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An sich wird der AHK Interpreter unkomprimitert nicht erkannt.
Die Komprimierung hat sich bei mir immer so Verhalten als ob man das AV Programm Fragen würde einen als Virus zu behandeln - d.h. verwende ich keine.
Sobald eine neue AHK Version rauskommt wird die normalerweise für 3-4 Wochen mit vielen False Positives belegt sein, danach reduziert sich die Menge erheblich.
Ältere Versionen vom AHK Interpreter können dann anfälliger sein.

Jedoch kann das verwenden von Skripten die Sicherheitsrelevante Aktionen ausführen immer noch zu Problemen führen.

Verstehe.

Bei diesem Punkt ging es mir momentan um die Frage einer möglichen Strategie, das Problem loszuwerden durch kompletten Verzicht aufs Compilieren (und ggf. auch aus Komprimieren). Jetzt stehen aber in deiner Antwort praktisch alle möglichen Antworten drin: "an sich" sei man das Problem los; steigt man auf eine neue Interpreter-Version um, hat man evtl. wochenlang doch Probleme; und verwendet jemand eine AHK-App, die als Skript+Interpreter konzipiert ist, kann er irgendeinmal dann doch wieder Probleme haben, weil "ältere Versionen ... dann anfälliger" werden können. Hab ich dich da richtig verstanden? (Man kommt und kommt nicht aus des Teufels Küche ...?)

Welche Erfahrungen haben andere hier zu diesem Punkt?

Ja man wird es nie ganz los.